Consiliul de Administrare este organul permanent de conducere al AOPD-ului, se subordonează Adunării Generale și este ales de către aceasta pe un termen de 2 ani. Președintele AOPD este concomitent și președintele Consiliului de Administrare.
Actualmente, membrii Consilului de Administrare sunt:
Vitalie MEȘTER
Președinte AOPD,
director executiv al Centrului pentru Drepturile Persoanelor cu Dizabilități
Victor KOROLI
director executiv AO „Infonet”
Ludmila MALCOCI
directoare executivă Keystone Moldova
Aliona DUMITRAȘ
directoare executivă AO „SOS Autism”
Victoria SECU
directoare executivă AO „Fiecare Contribuie pentru Schimbare”